Segmentace je proces vlastního napojení konkrétního segmentu ISP na veřejnou správu. Jde o vybudování pravidel a procesů, které vymezují konkrétní segment ISP. Dochází při něm k setkání představ všech zainteresovaných skupin s cílem ujasnit si vzájemná očekávání a vytvořit systémová pravidla. Segmentaci ISP OZP provedla v roce 2017-19 sociální inovace Ergoprogress.
Vytvořené podmínky musí být kompatibilní s obecnými principy sociálního podnikání. Ve většině procesů konkrétních ISP půjde o stejné či podobné řešení, rozdílný, ale bude psychosociální proces, který musí být šitý na míru potřebám konkrétního segmentu. ISP OZP má dnes vydefinovaný psychosociální proces ve formě integrační personalistiky. Důležitou součástí segmentace je i zajištění finančního rámce konkrétního segmentu. Nyní je tento segment plně financovaný veřejným sektorem. Je důležité, aby veřejný sektor pochopil příležitost na spolufinancování, které by přineslo větší flexibilitu, vytvořilo systémové financování celého segmentu ISP a spolufinancování problematiky privátními zdroji.